Los alimentos monoproteicos son especialmente eficaces para las mascotas con intolerancias alimentarias, pero, si se le dan a una mascota que no sufren de intolerancias, no tienen ningún beneficio.

En perros y gatos que muestran intolerancias alimentarias, puede emplearse una dieta de proteínas de fuente única como método de diagnóstico o como solución nutricional a largo plazo. La mayoría de las intolerancias alimentarias las generan las proteínas, por lo que la dieta de proteínas de fuente única puede ayudar a limitar la exposición a posibles alérgenos y es beneficiosa para perros y gatos que padezcan intolerancias. El uso profiláctico de alimentos monoproteicos para mascotas que, en consecuencia, limita el contacto del organismo con diversas proteínas, puede provocar alteraciones en la respuesta normal del sistema inmunitario. Por tanto, en mascotas sanas, no es necesario limitar las fuentes de proteínas en su comida, siempre y cuando tengan una dieta completa y equilibrada.